siRNA vs miRNA
RNA sú veľmi dôležité molekuly, ktoré pomáhajú budovať život organizmov. Vedci nedávno objavili malé RNA nazývané interferencia RNA alebo RNAi, ktoré po transkripcii pôsobia na kontrolu génovej expresie. Dva hlavné typy malých RNA sú mikro RNA alebo miRNA a malá interferujúca RNA alebo siRNA. Tieto molekuly v podstate regulujú génovú expresiu potlačením cieľového génu. Tak miRNA, ako aj siRNA majú veľmi podobné dráhy biogenézy, aj keď medzi nimi existujú určité rozdiely. Pôvod miRNA a siRNA sú z molekúl dsRNA. Zrelé miRNA sú štruktúrne podobné molekulám siRNA.
miRNA
Mikro RNA alebo miRNA sú malé molekuly RNA, ktoré sprostredkovávajú konečnú kontrolu regulácie translačného génu. Deregulácia miRNA môže viesť k rozvoju rakoviny a iných chorôb. Preto je správna regulácia informácií kódovaných v nekódujúcej oblasti miRNA veľmi dôležitá v mnohých základných bunkových procesoch.
siRNA
siRNA sa tiež označujú ako krátka interferujúca alebo umlčujúca RNA a sú tvorené dvojvláknovou RNA s 20 až 25 pármi báz. Hlavnou úlohou siRNA je interferovať s expresiou špecifických génov s komplementárnymi nukleotidovými sekvenciami. siRNA je tvorená krátkou dvojvláknovou RNA s fosforylovanými 5 'koncami a hydroxylovanými 3' koncami s dvoma previsnutými nukleotidmi.
Aký je rozdiel medzi siRNA a miRNA?
• miRNA odvodená zo špecifických genómových lokusov, zatiaľ čo siRNA odvodená od mRNA, transpozónov, vírusov alebo heterochromatickej DNA.
• Syntéza miRNA sa spracováva z dlhších prekurzorových vlásenkových transkriptov (primárna nukleárna miRNA sekvencia endonukleázou RNázy III), zatiaľ čo syntéza siRNA sa spracováva z dlhých bimolekulárnych duplexov RNA.
• Každá miRNA vlásenková prekurzorová molekula produkuje jeden miRNA duplex, zatiaľ čo každá prekurzorová molekula siRNA produkuje viac siRNA duplexov.
• sekvencie siRNA sú zriedka konzervované, zatiaľ čo sekvencie miRNA sú dobre konzervované.
• Všetky bázy v siRNA prispievajú k jej cieľovej špecifickosti, zatiaľ čo iba 5 'polovica miRNA prispieva k jej cieľovej špecifickosti.
• miRNA sa často viaže na 3 'neprekladanú oblasť cieľových transkriptov, zatiaľ čo siRNA tvoria komplementárny duplex kdekoľvek pozdĺž cieľovej mRNA.
• miRNA špecifikuje „hetero- umlčanie“, zatiaľ čo siRNA sa používa na „automatické umlčanie“.
• miRNA funguje ako signál na zabránenie translácie, zatiaľ čo siRNA fyzicky bráni translácii.
