Kľúčovým rozdielom medzi histopatológiou a cytológiou je, že histopatológiou je štúdium chorých tkanív pomocou mikroskopu, zatiaľ čo cytológiou je štúdium jednotlivých buniek tela.
Bunky sú základnými štruktúrnymi jednotkami života. Počas diagnostiky chorôb v medicíne skúmajú bunky a celé tkanivá patológovia. Štúdium tkanív vo vzťahu k chorobe je známe ako histopatológia. Naopak, štúdia jedného typu bunky je známa ako cytológia. Preto histopatológia sleduje tkanivá, zatiaľ čo cytológia jednotlivé bunky.
