Kľúčovým rozdielom medzi alozymami a izozymami je, že alozymy sú kódované rôznymi alelami na rovnakom mieste. Ale na rozdiel od toho sú izozýmy kódované génmi na rôznych lokusoch.
Enzýmy sú biokatalyzátory, ktoré urýchľujú biochemické reakcie. V skutočnosti sú to proteínové molekuly kódované génmi. Existujú rôzne druhy enzýmov. Niektoré enzýmy sú kódované rôznymi alelami toho istého génu prítomného na rovnakom mieste. Sú známe ako alozymy. Naopak, niektoré enzýmy sú kódované rôznymi génmi umiestnenými na rôznych miestach. Tieto enzýmy sú známe ako izozýmy. Izozýmy a alozymy sa môžu použiť na určenie vzťahu medzi dvoma organizmami.