Kľúčový rozdiel medzi fagocytózou a pinocytózou spočíva v tom, že fagocytóza je forma endocytózy, ktorá absorbuje pevné látky cez plazmatickú membránu do bunky, zatiaľ čo pinocytóza je ďalšou formou endocytózy, ktorá absorbuje tekutiny vrátane rozpustených látok a malých molekúl cez plazmatickú membránu do bunky.
Endocytóza je mechanizmus, pomocou ktorého bunky prijímajú makromolekuly a iné suspendované častice vrátane bunkových častí, makromolekulárnych agregátov a cudzích častíc do bunky. Exocytóza je opačný mechanizmus endocytózy, ktorým bunky vylučujú látky z buniek. Exocytóza prebieha hlavne v sekrečných bunkách. Existujú dva typy endocytózy založené na povahe častíc, ktoré sa odoberajú do živých buniek. Sú to fagocytóza a pinocytóza. Mechanizmus použitý v oboch procesoch je rovnaký. Tvoria vezikuly obklopujúce materiály, aby ich mohli vziať dovnútra. Oba procesy sú aktívne procesy. Preto môžete pozorovať mitochondrie v blízkosti povrchov, kde k týmto procesom dochádza.
