Kľúčový rozdiel medzi fagocytózou a opsonizáciou spočíva v tom, že fagocytóza je mechanizmus vykonávaný určitými bunkami alebo organizmami na požitie alebo pohltenie cudzích častíc, zatiaľ čo opsonizácia je proces, pri ktorom sa patogény odstraňujú zo systému po označení pomocou opsonínov.
Imunologické odpovede môžu byť vrodené alebo adaptívne. Patogény obsahujú receptory na rozpoznávanie patogénov, ktoré uľahčujú identifikáciu hostiteľa. Opsonizácia a fagocytóza sú dve imunologické odpovede. Pri opsonizácii hostiteľ identifikuje a označí napadnuté častice na zničenie produkciou opsonínov. Fagocytóza je mechanizmus, pomocou ktorého určité imunitné bunky pohlcujú a ničia invázne častice alebo cudzie častice z tela.
