Kľúčový rozdiel medzi dyneínom a kinezínom spočíva v tom, že dyneín je motorický proteín cytoskeletu, ktorý sa pohybuje smerom k mínus koncu mikrotubulov, zatiaľ čo kinezín je ďalší motorický proteín cytoskeletu, ktorý sa pohybuje smerom k plusovému koncu mikrotubulov.
Cytoskelet pozostáva z rôznych druhov vlákien. Jedným z nich sú mikrotubuly. Vedú pohyb materiálu v bunke. Sú tiež dôležité pre udržanie tvaru bunky. Okrem toho sú mikrotubuly životne dôležité pri separácii chromozómov pri mitóze a meióze. Ďalej sú mikrotubuly kľúčovými zložkami mihalníc a bičíkov niektorých eukaryotických buniek. Štrukturálne sú mikrotubuly polárne štruktúry. Majú plusový a mínusový koniec. Všeobecne platí, že mínus koniec sa tiahne smerom k stredu bunky, zatiaľ čo kladný koniec sa tiahne smerom k povrchu bunky. Počas intracelulárneho transportu vezikúl a organel pomáhajú mikrotubuly dva typy motorických proteínov cytoskeletu. Sú to dyneíny a kinezíny. Dyneíny sa pohybujú smerom k mínus koncu mikrotubulov, pričom prenášajú materiál do stredu bunky. Naproti tomu kinezíny cestujú smerom k povrchu bunky a nesú materiály na perifériu bunky.
