Kľúčový rozdiel medzi auxínom a cytokinínom je v tom, že auxín stimuluje vetvenie koreňov, zatiaľ čo cytokinín inhibuje vetvenie koreňov a bočnú tvorbu koreňov. Aby toho nebolo málo, auxín je zodpovedný hlavne za predĺženie buniek v kmeňových a koreňových špičkách, zatiaľ čo cytokiníny sú zodpovedné hlavne za delenie buniek, a preto sa nachádzajú v rastových oblastiach.
Fytohormóny známe tiež ako rastlinné hormóny sú dôležité chemické látky pre rast a vývoj rastlín. Sú to organické molekuly a fungujú ako signálne molekuly, ktoré regulujú vývoj rastlín. Existuje päť hlavných typov rastlinných hormónov: auxín, giberelín, cytokinín, etylén a kyselina abscisová. Vykonávajú tak rôzne funkcie samostatne a spoločne, aby ovplyvnili rast rastlín.