Kľúčovým rozdielom medzi porínmi a aquaporínmi je, že poríny sú póry a kanály naplnené vodou, ktoré sa nachádzajú v membránach baktérií a eukaryotov. Medzitým sú aquaporíny membránové proteíny, ktoré vytvárajú v živých bunkách kanály selektívne pre vodu.
Rôzne molekuly vstupujú a vystupujú z bunky cez plazmatickú membránu v živých organizmoch. V plazmatickej membráne teda existujú rôzne membránové proteíny, ktoré udržiavajú a regulujú molekuly vstupujúce a vychádzajúce z buniek. Poriny a aquaporíny sú dva také typy membránových proteínov. Z nich sú póry vodou vyplnené póry, ktoré uľahčujú transport hydrofilných molekúl cez membránu. Medzitým sú aquaporíny vodnými selektívnymi kanálmi, ktoré špecificky umožňujú vode voľne prechádzať cez membránu.
